Физиотерапия назначается при неврологических расстройствах, включая последствия инсультов (спастические парезы, дисфагия), нейропатии, радикулопатии и вертеброгенные болевые синдромы. В ортопедии и травматологии она применяется для реабилитации после переломов, разрывов связок, а также при деформирующих артрозах, остеохондрозе и контрактурах суставов. Кардиологические показания охватывают постинфарктную реабилитацию, направленную на стабилизацию коронарного кровотока, и хроническую сердечную недостаточность I-II функционального класса. Пульмонологические нарушения, такие как бронхиальная астма, ХОБЛ и остаточные явления пневмоний, также входят в спектр применения. Кроме того, физиотерапия эффективна при коррекции психосоматических и вегетативных дисфункций — синдроме хронической усталости, тревожных расстройствах и нарушениях сна, вызванных гипертонусом симпатической нервной системы.

Выбор методик основывается на патогенезе заболевания. Например, ультразвуковая терапия с фонофорезом гидрокортизона показана при мышечно-тонических синдромах, транскраниальная магнитная стимуляция — при периферической нейропатии, а лазеротерапия в красном или инфракрасном спектре — для улучшения микроциркуляции в поврежденных тканях.

К абсолютным противопоказаниям относятся острые инфекционные процессы с температурой выше 38°C или признаками бактериемии, декомпенсированные соматические патологии (ХСН III-IV функционального класса, печеночная или почечная недостаточность), онкологические заболевания вне стадии ремиссии, а также нарушения целостности кожных покровов в зоне воздействия, такие как трофические язвы или ожоги. Относительные противопоказания включают беременность (I триместр), наличие имплантированных кардиостимуляторов (для методов с электромагнитным полем) и склонность к кровоточивости, которая ограничивает применение ударно-волновой терапии. В этих случаях решение о назначении физиотерапии принимается индивидуально, после анализа соотношения рисков и потенциальной пользы для пациента.